Эм я понял, что Алек у нас походу сам себе дедушка!

На по концовке я понял так.
Алек Седлер из будущего по каким-то своим соображениям послал террористов и Киру в прошлое, чтобы изменить будущее и самого себя, заодно послал и своего папашку, который по совместистельству оказался сыном (?). лол.
Параллельно с Сэдлером работает еще одна организация - Фрилансеры. Некоторая секта борцов за чистоту континуума. Я как понял она из еще дальнего будущего. Фрилансеры прыгают в разные эпохи и пытаются исправить все то, что напортил Седлер. А именно отлавливают всех случайных и не очень путешественников, изолируют их и консервируют. Главная цель фрилансеров - Сэдлер, но сразу к нему подступиться они то ли не могут, то ли не хотят. Седлер - ключ к путешествию во времени и они хотят полностью контролировать эту технологию. Тут на сцену выходит Эшер, он из фрилансеров, наверняка самый главный из них, хотя он и отрицает связь с ними, типа я действую сам по себе во благо семейного бизнеса. Эшер манипулирует всеми до кого может дотянуться. Посылает девочку к Алеку, чтобы та воровала технологии и заодно оберегала от различных охотников. Наверняка Эшер решил прибрать всю технологию себе и стать богом. Однако он не ожидал что у Алека все серьезно с Эмили и когда Эмили убивают, он впаривает Алеку что он его отец и предлагает править голагтикой. Алек находясь в упадке от любовной потери, обижен на Киру, но мне показалось не винит ее, а скорее решает прикрыться ею. В его голове зреет план, который должен обмануть Эшера и вернуть к жизни Эмили. Алеку нужен Эшер с его технологией, поэтому он становится его "сыном", заманивает в ловушку Киру и находясь под дулами фрилансеров делает ноги во времени.
Алек просек, что ситуация зашла слишком далеко, ему не дадут жизни ни фрилансеры, ни Эшер, а так же Киру наверняка отправят в расход. (Я уверен все это было в послании к самому себе), чтобы не допустить всего этого, он тупо делает ход конем и предает всех и вся ради собственного плана.
Что из этого получится будет видно в третем сезоне.
Сэдлер что-то долго грузил в интерфейс Киры, явно не просто так.
Потом Карлос по ходу переходит на сторону Джулиану, тоже не просто так. Карлос знает практически все что было и что будет, думаю он будет присматривать за ним, так как фрилансеры переловили и всех террористов, кроме негра в дурке.
Ну а Кира главный инструмент борьбы. В общем третий сезон должен быть интересным. Лишь бы не перемудрили. Реально сложно понимать его.

Мой мозг всё равно этого не понял!

Я все думаю про послание, не зря Алек после прочтения отстранился от Киры да и вообще свалился в дипресняк.
Старый Седлер наверняка расписал какой он мудак, и что Кира всего лишь инструмент, которым нужно будет воспользоваться в момент, когда станет все хреново.
Хреново наступило, Алек подставил Киру, как завещал старикашка, так как уверен, что спасет себя и всех сразу, а заодно поимеет всех врагов.
Всякие фрилансеры и Эшер придуманы сценаристами чтобы трахать мозг.